牛樟芝的科学命名几经风波，在学术界也引发一番论战，却也因此让原本就非常受注目的台湾特有真菌，更添加了其话题性。

 

1.1990 年臧穆教授与苏庆华教授在“云南植物研究”发表新种学名为Ganoderma comphoratum。认为是灵芝属的一个新种。

 

2.1995 年张东柱博士与周文能先生于英国真菌学研究期刊“Mycological Research”发表新种，学名为：Antrodia cinnamomea。认为是薄孔菌属(Antrodia) 的一个新种。

 

3. 经吴声华博士检验两次所发表新种的模式标本后，发现皆为牛樟芝。只是第一次发表的模式标本有灵芝的孢子沾染，因观察到灵芝的孢子型态而误以为牛樟芝是灵芝一属。因此1997 年吴声华博士、国际多孔菌分类首席权威Dr.Ryvarden 与张东柱博士共同发表，把第一次发表名称因误描述到类似灵芝孢子而误置于灵芝属(Ganoderma) ，修订处理为较合理的薄孔菌属(Antrodia)，而第一次发表名称享有命名法规之先取权优势，因此种名不变，学名为：Antrodia camphorata。

 

4.2004 年张东柱博士与周文能先生在“中研院植物学汇刊”提出，1990 年臧穆教授与苏庆华教授发表新种时是描述标本中之灵芝部分，非牛樟芝部分，因此提出应回复使用Antrodia cinnamomea 为牛樟芝学名。

 

5. 于2004 同一年，吴声华博士在“中华民国真菌学会刊”发文指出，由牛樟芝LSUrDNA 序列分析结果发现，牛樟芝与薄孔菌属(Antrodia) 的亲缘关系并不相近，因此提出牛樟芝为多孔菌的新属：台芝属(Taiwanofungus)。并以1990 年发表的牛樟芝种名， 发表新的牛樟芝学名为Taiwanofungus camphoratus。

 

6. 余知和等在 2010 年发表于Botanical Studies 之系统学研究结果，支持台芝属(Taiwanofungus) 的独立属地位。

 

7.2010 年 Dictionary of Fungi ( 真菌字典) 第一作者暨 Index Fungorum ( 真菌索引) 资料库负责人Dr.Paul Kirk 依据国际植物命名法规研究牛樟芝命名之后，认定牛樟芝正名为Taiwanofungus camphoratus (Ganoderma comphoratum, Antrodia camphorata 和Antrodia cinnamomea 皆为同义名)。

 

8.2010 年 MycoBank ( 真菌银行，世界上最具权威之真菌资料库) 专家 Dr. JoostStalpers 依据国际植物命名法规研究牛樟芝命名之后， 认定牛樟芝正名为Taiwanofungus camphoratus (Ganoderma comphoratum, Antrodia camphorata 和Antrodia cinnamomea 皆为同义名)。

 

9.2010 年财团法人食品工业发展研究所拥有台湾最具规模之生物资源保存及研究中心选用Antrodia cinnamomea 为牛樟芝学名。

 

目前牛樟芝的科学命名或许还需要学术界更多的共识来达成统一，但牛樟芝在健康食品与新药研发应用上却是如日中天的蓬勃发展，不管牛樟芝最后的科学命名会是哪一个，它是台湾国宝级特有真菌的地位是不容置疑的。